71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0584 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  100 
 
 
413 aa  832  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  36.97 
 
 
385 aa  221  2e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  32.14 
 
 
420 aa  156  5e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  29.9 
 
 
417 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  30.36 
 
 
427 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  30.2 
 
 
427 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.7 
 
 
346 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  31.17 
 
 
392 aa  136  7e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  29.68 
 
 
417 aa  135  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  31.43 
 
 
444 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  31.68 
 
 
375 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  29.18 
 
 
406 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  31.3 
 
 
407 aa  129  7e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  28.71 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  29.21 
 
 
427 aa  127  4e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  28.47 
 
 
410 aa  126  8e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  28.47 
 
 
410 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  33.43 
 
 
383 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  31.83 
 
 
442 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  42.29 
 
 
376 aa  118  2e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  30.88 
 
 
388 aa  114  4e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  26.99 
 
 
386 aa  113  7e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  28.92 
 
 
426 aa  110  4e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  28.92 
 
 
377 aa  109  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  28.92 
 
 
377 aa  109  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  26.27 
 
 
415 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  27.13 
 
 
376 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  26.33 
 
 
366 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  30.43 
 
 
397 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  29.89 
 
 
400 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  29.37 
 
 
433 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  29.37 
 
 
433 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  28.17 
 
 
451 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  29.37 
 
 
433 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  30.27 
 
 
409 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  24.93 
 
 
379 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  32.47 
 
 
397 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  26.55 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  26.55 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  28.71 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  26.25 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  30.11 
 
 
367 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  36.48 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  24.89 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  24.59 
 
 
432 aa  76.6  8e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  23.8 
 
 
434 aa  65.9  1e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  22.77 
 
 
450 aa  60.5  6e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  23.56 
 
 
481 aa  57.4  4e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  23.69 
 
 
422 aa  56.6  8e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  23.04 
 
 
450 aa  55.8  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1122  Triacylglycerol lipase  26.49 
 
 
444 aa  54.7  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  28.79 
 
 
426 aa  53.5  6e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  27.02 
 
 
450 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  21.25 
 
 
482 aa  52.8  1e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  27.02 
 
 
450 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  27.02 
 
 
450 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  22.05 
 
 
464 aa  51.6  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  32.67 
 
 
527 aa  50.1  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  23.54 
 
 
450 aa  49.7  9e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
281 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  25.55 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  22.32 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  25.58 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.14 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  32.26 
 
 
201 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  25.58 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  25.58 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  36.46 
 
 
897 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  30.26 
 
 
528 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  24.72 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  27.5 
 
 
422 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>