More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0578 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
273 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  89.01 
 
 
274 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  89.01 
 
 
274 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  88.69 
 
 
274 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  84.67 
 
 
274 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  84.44 
 
 
271 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  82.96 
 
 
274 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  71.22 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  72.32 
 
 
277 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  71.48 
 
 
274 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  69.74 
 
 
275 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  69.74 
 
 
299 aa  400  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  69.12 
 
 
277 aa  397  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  68.52 
 
 
275 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  67.78 
 
 
278 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  67.41 
 
 
278 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  68.13 
 
 
279 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  64.98 
 
 
278 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  67.16 
 
 
273 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  65.17 
 
 
276 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  64.36 
 
 
276 aa  362  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  64.39 
 
 
279 aa  361  8e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
274 aa  357  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  62.22 
 
 
275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  63.88 
 
 
279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  64.02 
 
 
274 aa  355  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  64.21 
 
 
283 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  61.85 
 
 
274 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  64.42 
 
 
279 aa  352  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  63.12 
 
 
284 aa  350  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  62.36 
 
 
284 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  63.67 
 
 
279 aa  347  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 
263 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  59.34 
 
 
293 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  59.41 
 
 
276 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 
271 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  59.18 
 
 
293 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  59.18 
 
 
293 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 
271 aa  322  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  62.1 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  62.9 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  58.53 
 
 
271 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  54.15 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  54.15 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  54.69 
 
 
266 aa  277  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 
255 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.02 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  53.12 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  54.66 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  54.09 
 
 
266 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  55.93 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
258 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  55.93 
 
 
260 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  53.12 
 
 
262 aa  269  5e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  55.93 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  51.01 
 
 
260 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  55.93 
 
 
260 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 
268 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 
268 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  55.92 
 
 
275 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
261 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
261 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  53.97 
 
 
267 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  53.72 
 
 
284 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  55.97 
 
 
267 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  51.01 
 
 
268 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 
260 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  53.6 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 
258 aa  261  6e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
263 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
270 aa  261  8e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
275 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
272 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
273 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
268 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  51.59 
 
 
270 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
261 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  51.17 
 
 
274 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
277 aa  258  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.38 
 
 
270 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  52.94 
 
 
256 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  53.75 
 
 
277 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  49.43 
 
 
266 aa  257  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  52.89 
 
 
267 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
263 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
276 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  48.57 
 
 
255 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>