More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0535 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  100 
 
 		 91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  73.33 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  70.45 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  70.79 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  70.79 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  68.54 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  53.33 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  59.77 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  59.77 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  58.43 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  56.32 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  74.24 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  56.63 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  56.98 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  54.22 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  57.32 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  60.42 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  53.09 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  51.85 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  51.69 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  51.81 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  50 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  53.93 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  48.98 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  48.98 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  54.44 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  53.93 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  51.69 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  50 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  49.38 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  50 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  48.89 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  52.22 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  46.59 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  46.91 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  48.86 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  51.19 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  52 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  47.73 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  48.05 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  46.59 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  48.15 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  46.59 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  49.37 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  46.59 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  46.59 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  48.81 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  49.28 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  44.87 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  43.18 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  45.78 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  44.05 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  40.21 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  41.57 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  44.32 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  44.71 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  44.44 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  44.05 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  39.77 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  41.3 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  43.02 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  44.71 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  48.15 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  48.72 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  43.9 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  38.64 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  43.9 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  40.7 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  40 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  43.9 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  46.67 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  48.72 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  42.05 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  41.46 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  46.67 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  47.44 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  42.68 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  41.46 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  43.37 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  44.3 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  47.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  49.38 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  44.44 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>