More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0469 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  100 
 
 		 352 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  89.43 
 
 		 349 aa  628  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  87.98 
 
 		 345 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  86.32 
 
 		 351 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  89.35 
 
 		 344 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  88.18 
 
 		 351 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  86 
 
 		 349 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  67.85 
 
 		 379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  60.56 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  59.13 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  59.47 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  61.76 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  61.64 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  62.03 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  61.66 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  61.64 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  61.59 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  61.71 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  59.39 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  61.13 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  61.83 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  59.2 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  61.71 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  59.38 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  55.38 
 
 		 370 aa  345  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.73 
 
 		 342 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  53.8 
 
 		 360 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.02 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  52.62 
 
 		 346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  52.62 
 
 		 346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  52 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  52.52 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  50.89 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  49.56 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  50.91 
 
 		 375 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  51.41 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  47.31 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  48.45 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.47 
 
 		 326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  49.55 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  50.32 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50.33 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  48.17 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.57 
 
 		 323 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  48.58 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  45.34 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.62 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  48.15 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.81 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.65 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  46.86 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  47.78 
 
 		 315 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  47.78 
 
 		 315 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  47.91 
 
 		 359 aa  292  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  48.2 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  49.84 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.46 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  48.92 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  50.97 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  50.33 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  50.33 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.1 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.1 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.1 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  47.88 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  50.16 
 
 		 341 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  47.88 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.56 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  47.87 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  49.35 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  48.49 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  48.49 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.06 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  48.49 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  49.68 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  48.49 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  48.28 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  47.37 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  50.16 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  48.79 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  50.16 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.2 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  48.2 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  47.92 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  48.2 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0022  PhoH family protein  47.54 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.123804  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  50.64 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.2 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  48.2 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  45.78 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  49.38 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  48.88 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  49.83 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  48.53 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>