201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0422 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  100 
 
 
505 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  58.66 
 
 
490 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  54.1 
 
 
508 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  55.07 
 
 
306 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  53.79 
 
 
314 aa  292  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  51.33 
 
 
306 aa  289  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  55.52 
 
 
322 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  53.18 
 
 
355 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  50.34 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  52.54 
 
 
301 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  51.53 
 
 
371 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  48.28 
 
 
336 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  46.69 
 
 
371 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  45.78 
 
 
366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  47.18 
 
 
305 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  47.86 
 
 
1138 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  45.64 
 
 
329 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  43.85 
 
 
311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  49.47 
 
 
286 aa  228  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  45.16 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  42.57 
 
 
298 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  62.64 
 
 
188 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  40 
 
 
331 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  58.29 
 
 
185 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  37.58 
 
 
329 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.71 
 
 
320 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  53.14 
 
 
209 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.71 
 
 
312 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  41.01 
 
 
274 aa  170  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3101  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  44.74 
 
 
260 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.03 
 
 
330 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  44.75 
 
 
197 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  36.99 
 
 
312 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.84 
 
 
309 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  50.88 
 
 
182 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.06 
 
 
313 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.26 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  36.33 
 
 
295 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.83 
 
 
368 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.87 
 
 
308 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.11 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.44 
 
 
329 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.71 
 
 
300 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.86 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.45 
 
 
296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.79 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.4 
 
 
294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  33.67 
 
 
294 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.31 
 
 
301 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.75 
 
 
463 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  30.27 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.92 
 
 
343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  39.73 
 
 
467 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.49 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  30.77 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.27 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.16 
 
 
701 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.67 
 
 
308 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3365  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.05 
 
 
308 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  hitchhiker  0.000474604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3043  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  34.26 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2408  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.9 
 
 
297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  normal  0.0934858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.66 
 
 
338 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0035  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.71 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.378473  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.13 
 
 
698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.13 
 
 
698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.33 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.48 
 
 
308 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600884  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  31.23 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.23 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.85 
 
 
301 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.27 
 
 
317 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  44.13 
 
 
197 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0763  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.82 
 
 
273 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.1 
 
 
295 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1105  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.27 
 
 
484 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5181  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.81 
 
 
318 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3034  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  34.21 
 
 
306 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  38.64 
 
 
179 aa  98.6  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  36.26 
 
 
167 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  33.93 
 
 
168 aa  96.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2379  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.79 
 
 
469 aa  96.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000403878  hitchhiker  0.00126048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.33 
 
 
302 aa  96.3  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
164 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
279 aa  93.6  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  32.54 
 
 
166 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  38.73 
 
 
179 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  37.01 
 
 
164 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  37.16 
 
 
189 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03580  ADP-ribosylglycohydrolase  32.68 
 
 
447 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.53 
 
 
270 aa  86.7  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.18 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.4 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.28 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  34 
 
 
165 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.93 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  23.64 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  23.8 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  35.06 
 
 
155 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.16 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  30.16 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>