26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0410 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  88.51 
 
 
87 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  92.5 
 
 
88 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  93.67 
 
 
88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  87.5 
 
 
88 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  79.76 
 
 
88 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  85.53 
 
 
88 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  71.43 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  66.25 
 
 
83 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  63.75 
 
 
83 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  61.84 
 
 
88 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  55.95 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  55.95 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  64.79 
 
 
98 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  63.38 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  55.26 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  47.37 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  47.89 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  46.05 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  46.48 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  52.11 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  52.11 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  44.74 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  47.5 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  28.95 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  35 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>