More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0363 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  60.95 
 
 
881 aa  1030  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  60.4 
 
 
880 aa  1026  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  56.94 
 
 
919 aa  924  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  61.22 
 
 
916 aa  1004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  55.42 
 
 
914 aa  971  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  61.58 
 
 
929 aa  959  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  60.89 
 
 
962 aa  953  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  59.95 
 
 
905 aa  911  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  60.2 
 
 
883 aa  1021  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  59.57 
 
 
925 aa  947  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  57.22 
 
 
875 aa  893  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  63.22 
 
 
921 aa  1032  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  81.98 
 
 
888 aa  1428  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.21 
 
 
929 aa  895  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  55.83 
 
 
878 aa  894  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  84.14 
 
 
907 aa  1485  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  86.45 
 
 
923 aa  1515  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  52.68 
 
 
897 aa  818  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  87.3 
 
 
907 aa  1522  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  60.77 
 
 
896 aa  992  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
882 aa  1763  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.52 
 
 
877 aa  869  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
804 aa  678  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 
864 aa  726  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  48.36 
 
 
858 aa  728  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  87.63 
 
 
911 aa  1529  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 
873 aa  664  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  60.85 
 
 
908 aa  1026  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
804 aa  681  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  61.34 
 
 
916 aa  1008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 
910 aa  1017  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 
904 aa  728  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
820 aa  704  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  48.09 
 
 
882 aa  642  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  82.67 
 
 
910 aa  1443  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  61.04 
 
 
915 aa  988  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  3.55609e-05 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 
898 aa  1019  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  59.15 
 
 
910 aa  1015  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.18 
 
 
876 aa  890  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  56.29 
 
 
877 aa  872  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.03 
 
 
908 aa  944  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  55.37 
 
 
879 aa  888  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.28 
 
 
904 aa  805  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  57.11 
 
 
880 aa  889  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
871 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.92 
 
 
868 aa  627  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.77149e-05  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 
815 aa  620  1e-176  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
872 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.38373e-07  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
872 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 
891 aa  618  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
900 aa  608  1e-172  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 
869 aa  606  1e-172  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 
870 aa  603  1e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 
898 aa  602  1e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 
932 aa  603  1e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 
880 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 
887 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 
855 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
855 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 
870 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 
870 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01093e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 
881 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
869 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
859 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 
863 aa  592  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 
859 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
873 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 
872 aa  583  1e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 
892 aa  583  1e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 
897 aa  582  1e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 
859 aa  585  1e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 
859 aa  582  1e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 
872 aa  584  1e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 
861 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  37.69 
 
 
896 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.98 
 
 
863 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
862 aa  581  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 
889 aa  575  1e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
861 aa  577  1e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 
854 aa  576  1e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 
856 aa  577  1e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 
823 aa  578  1e-163  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
939 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 
858 aa  579  1e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
939 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.57 
 
 
868 aa  575  1e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
938 aa  578  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
891 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
939 aa  577  1e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
881 aa  577  1e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
894 aa  577  1e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  3.91787e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
861 aa  578  1e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
861 aa  576  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 
916 aa  573  1e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 
910 aa  572  1e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
893 aa  573  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 
856 aa  575  1e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
910 aa  573  1e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 
939 aa  575  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 
860 aa  574  1e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>