More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0336 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  87.86 
 
 		 207 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  83.98 
 
 		 207 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  83.98 
 
 		 207 aa  357  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  77.56 
 
 		 207 aa  340  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  75.5 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  76.38 
 
 		 206 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  75.38 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  75.88 
 
 		 206 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  74.5 
 
 		 208 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  72.5 
 
 		 208 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  72 
 
 		 206 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  72.08 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 212 aa  293  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  70.05 
 
 		 211 aa  288  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  69.54 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  67 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  66.33 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  67.5 
 
 		 212 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  58.29 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  58.88 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  48.61 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.1 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.38 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  47.14 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  49.55 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  55.38 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  55.85 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 247 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  47.6 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  46.4 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  48.15 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  51.76 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  47.35 
 
 		 229 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  47.71 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  47.22 
 
 		 247 aa  194  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  45.98 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.83 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  50.43 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  43.17 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  46.33 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.91 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  48.88 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  44.91 
 
 		 249 aa  188  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 247 aa  188  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  45.98 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.86 
 
 		 248 aa  188  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 		 251 aa  187  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  46.26 
 
 		 247 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.64 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  48.6 
 
 		 249 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.23 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  47.03 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.93 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  45.83 
 
 		 247 aa  185  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 237 aa  185  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.3 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 250 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 250 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  47.69 
 
 		 250 aa  184  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 		 245 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  45.98 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  45.83 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>