161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0293 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  79.14 
 
 		 146 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  81.16 
 
 		 146 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  77.7 
 
 		 146 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  66.19 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  67.63 
 
 		 139 aa  199  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  62.59 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  62.5 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  62.5 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  61.54 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  61.81 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  61.43 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  59.57 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  59.29 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  57.97 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  58.7 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  57.97 
 
 		 178 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  61.19 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  57.25 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  56.83 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  53.96 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  52.17 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  53.24 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  55.4 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  46.76 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  52.17 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  46.81 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  46.81 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  43.97 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  44.37 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  44.06 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  47.1 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  47.14 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  41.55 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  43.97 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  49.3 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  41.55 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  49.26 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  50.74 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  48.53 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  47.48 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  46.48 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  46.48 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  43.97 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  39.57 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  43.97 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  45 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  45.65 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  41.91 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  41.89 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  47.86 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  44.68 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  42.03 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  41.79 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  46.38 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  47.14 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  43.97 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  48.53 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  42.03 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  41.3 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  42.96 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  45.65 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  41.96 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  40.28 
 
 		 194 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  39.01 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  39.01 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  42.14 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  39.01 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  38.85 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  42.34 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  38.19 
 
 		 187 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  42.62 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  41.38 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  40.46 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  40.46 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  39.86 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  41.61 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  38.57 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  38.69 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  37.86 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  37.86 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  39.72 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>