28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0285 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  70.72 
 
 		 194 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  77.5 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  74.38 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  73.12 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0092  hypothetical protein  66.48 
 
 		 194 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  65.93 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  36.21 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  31.68 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  34.1 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  30.46 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  30.38 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  31.06 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  34.5 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  34.5 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  30.38 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  35.52 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  30.06 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  28.66 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  32.72 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  28.66 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  34.64 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  28.03 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  27.61 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  28.85 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>