63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0281 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  79.31 
 
 		 189 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  75.44 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  74.27 
 
 		 187 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  73.48 
 
 		 213 aa  259  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  71.76 
 
 		 173 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  75.16 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  51.72 
 
 		 178 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  51.11 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.56 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  47.06 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  49.02 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.4 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  41.71 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  39.57 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  47.7 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  40.48 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  47.7 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  41.61 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  40.7 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  45.64 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  44.76 
 
 		 170 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  44.97 
 
 		 170 aa  121  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  37.72 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  45.21 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  35.06 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.24 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  38.18 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  38.18 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  43.15 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  35.96 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  43.84 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  43.84 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  43.51 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  46.41 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  40.67 
 
 		 151 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  40.67 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  40.52 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  39.61 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  31.79 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  35.03 
 
 		 503 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  34.81 
 
 		 503 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  35.14 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 		 314 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  31.85 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  31.79 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.45 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  34.84 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.32 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  31.69 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  25.34 
 
 		 530 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  29.46 
 
 		 269 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.29 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  25.68 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  23.95 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  25.96 
 
 		 454 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  28.22 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  28.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  28.29 
 
 		 217 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  25.31 
 
 		 313 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>