More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0276 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.85 
 
 
787 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.11 
 
 
1135 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.24 
 
 
1134 aa  766    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  62.52 
 
 
704 aa  660    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.92 
 
 
895 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.05 
 
 
894 aa  692    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.24 
 
 
1091 aa  767    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.08 
 
 
881 aa  871    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  57.93 
 
 
854 aa  875    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  70.89 
 
 
821 aa  740    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.5 
 
 
1094 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.49 
 
 
871 aa  914    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.1 
 
 
852 aa  872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  58.2 
 
 
874 aa  879    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.79 
 
 
1153 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.24 
 
 
781 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  54.52 
 
 
806 aa  813    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  70.97 
 
 
954 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  78.38 
 
 
833 aa  1261    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  67.64 
 
 
1091 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.44 
 
 
872 aa  894    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  67.5 
 
 
1094 aa  698    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.8 
 
 
890 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.18 
 
 
809 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.36 
 
 
807 aa  688    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  78.83 
 
 
825 aa  1244    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.73 
 
 
726 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  51.61 
 
 
849 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  62.84 
 
 
797 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.54 
 
 
889 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.88 
 
 
825 aa  1257    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  56.8 
 
 
963 aa  710    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
815 aa  1648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  67.86 
 
 
995 aa  705    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  56.86 
 
 
880 aa  875    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.35 
 
 
1040 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.29 
 
 
823 aa  1257    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.64 
 
 
858 aa  882    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.31 
 
 
835 aa  1281    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.1 
 
 
830 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  68.63 
 
 
1015 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.1 
 
 
792 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.53 
 
 
853 aa  757    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.98 
 
 
882 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  59.4 
 
 
840 aa  866    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  70.4 
 
 
872 aa  721    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.39 
 
 
822 aa  1267    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.88 
 
 
902 aa  886    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.84 
 
 
951 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  51.85 
 
 
808 aa  745    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.4 
 
 
888 aa  769    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.57 
 
 
845 aa  766    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  70.7 
 
 
819 aa  740    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.55 
 
 
1221 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.1 
 
 
871 aa  913    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.43 
 
 
1136 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.02 
 
 
826 aa  928    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.83 
 
 
912 aa  634  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  58.66 
 
 
848 aa  625  1e-178  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  59.27 
 
 
827 aa  624  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  57.6 
 
 
793 aa  602  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  61.12 
 
 
809 aa  594  1e-168  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  53.92 
 
 
1477 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.73 
 
 
757 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  41.76 
 
 
776 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.79 
 
 
786 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  41.08 
 
 
770 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  42.61 
 
 
769 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.61 
 
 
789 aa  522  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.38 
 
 
786 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.74 
 
 
716 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  42.21 
 
 
775 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.15 
 
 
781 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.82 
 
 
770 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.92 
 
 
799 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.15 
 
 
781 aa  512  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  54.8 
 
 
769 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  40.73 
 
 
801 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.69 
 
 
763 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  42.36 
 
 
774 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  42.06 
 
 
814 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  52.49 
 
 
776 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.64 
 
 
784 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  40.83 
 
 
771 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.17 
 
 
787 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.61 
 
 
770 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.3 
 
 
776 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  49.56 
 
 
745 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.03 
 
 
834 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.05 
 
 
831 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  54.02 
 
 
768 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  54.02 
 
 
822 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  54.02 
 
 
822 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  40.64 
 
 
801 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  54.02 
 
 
822 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  50.56 
 
 
751 aa  505  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  54.02 
 
 
768 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  54.02 
 
 
822 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.2 
 
 
769 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  54.02 
 
 
768 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>