16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0250 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0250  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66839  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5949  hypothetical protein  56.03 
 
 
204 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1584  hypothetical protein  47.12 
 
 
227 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5007  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536268  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 
201 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0024  hypothetical protein  39.56 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1803  hypothetical protein  39.13 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0310445  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1852  hypothetical protein  39.13 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2715  hypothetical protein  40.43 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2187  hypothetical protein  39.13 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1935  hypothetical protein  33.94 
 
 
197 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2588  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1246  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3947  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0213585  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0031  hypothetical protein  37.36 
 
 
196 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0472  hypothetical protein  34.65 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>