More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0157 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  100 
 
 
349 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  88.67 
 
 
353 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  88.35 
 
 
353 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  86.93 
 
 
353 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  84.36 
 
 
358 aa  584  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  86.25 
 
 
356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  84.36 
 
 
358 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.12 
 
 
344 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.52 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.81 
 
 
348 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.83 
 
 
346 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.47 
 
 
344 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.91 
 
 
344 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.91 
 
 
344 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.65 
 
 
342 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.47 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.38 
 
 
348 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  69.16 
 
 
364 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  69.76 
 
 
364 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  68.4 
 
 
349 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  66.08 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  67.48 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  63.79 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  66.08 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  60.23 
 
 
391 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.12 
 
 
350 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  63.19 
 
 
339 aa  408  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  63.87 
 
 
345 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  65.35 
 
 
332 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  65.03 
 
 
343 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  62.15 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  67.66 
 
 
336 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.98 
 
 
351 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  63.29 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  70.12 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  63.29 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  63.79 
 
 
359 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.66 
 
 
344 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  58.67 
 
 
345 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  57.64 
 
 
348 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  56.7 
 
 
352 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  55.66 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  49 
 
 
340 aa  317  2e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.52 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  51.61 
 
 
340 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.57 
 
 
356 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.85 
 
 
402 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.35 
 
 
417 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  51.45 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  51.45 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.39 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  51.45 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  56.99 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.92 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.53 
 
 
354 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.53 
 
 
354 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 
426 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50.42 
 
 
356 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.24 
 
 
354 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.66 
 
 
338 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50.45 
 
 
407 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.7 
 
 
347 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  47.38 
 
 
340 aa  298  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.8 
 
 
407 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.7 
 
 
408 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.08 
 
 
364 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.18 
 
 
353 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  53.26 
 
 
346 aa  295  6e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.31 
 
 
338 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.4 
 
 
407 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50 
 
 
353 aa  295  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  52.08 
 
 
364 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.42 
 
 
406 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.75 
 
 
345 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.87 
 
 
350 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  53.42 
 
 
408 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  53.42 
 
 
408 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  54.55 
 
 
338 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.85 
 
 
329 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  51.06 
 
 
343 aa  291  9e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.85 
 
 
329 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  51.81 
 
 
357 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.58 
 
 
365 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  52.82 
 
 
348 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  53.08 
 
 
408 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.43 
 
 
390 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.12 
 
 
365 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  49.43 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  55.02 
 
 
406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  49.29 
 
 
362 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  54.67 
 
 
406 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  48.85 
 
 
392 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.61 
 
 
370 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  55.07 
 
 
390 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  47.85 
 
 
352 aa  288  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  55.07 
 
 
390 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  55.07 
 
 
390 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  48.72 
 
 
379 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.35 
 
 
366 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.45 
 
 
425 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>