More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0086 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  74.32 
 
 
260 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  75.1 
 
 
259 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  74.32 
 
 
260 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  72.76 
 
 
260 aa  360  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  71.21 
 
 
260 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  65.64 
 
 
260 aa  327  1e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  57.2 
 
 
260 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  48.22 
 
 
266 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  52.85 
 
 
271 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  52.76 
 
 
271 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  50.81 
 
 
271 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  47.01 
 
 
259 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  52.17 
 
 
260 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  44.05 
 
 
258 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  49.39 
 
 
264 aa  184  2e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  47.64 
 
 
270 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.56 
 
 
405 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  52.17 
 
 
271 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.27 
 
 
536 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  45.45 
 
 
251 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  51.78 
 
 
271 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
490 aa  179  5e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
255 aa  179  6e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41.5 
 
 
252 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  40.48 
 
 
257 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
293 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.29 
 
 
266 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
258 aa  174  1e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 
266 aa  172  3e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  46.25 
 
 
267 aa  172  6e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
258 aa  171  8e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.61 
 
 
266 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.6 
 
 
255 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
255 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.6 
 
 
255 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
255 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  42.19 
 
 
271 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  5.06205e-09 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
255 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  39.73 
 
 
424 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
266 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
272 aa  168  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.8 
 
 
414 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  34.03 
 
 
253 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.32 
 
 
270 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  41.98 
 
 
262 aa  164  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.38 
 
 
266 aa  164  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  36.51 
 
 
258 aa  164  2e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  48.47 
 
 
253 aa  164  2e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
262 aa  164  2e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  43.75 
 
 
255 aa  163  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  45.3 
 
 
257 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
273 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
259 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.6 
 
 
260 aa  162  4e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.39 
 
 
424 aa  162  4e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.97 
 
 
255 aa  162  4e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.24 
 
 
263 aa  162  5e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  162  5e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.8 
 
 
625 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  43.67 
 
 
250 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
250 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  161  8e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.09969e-12 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.61 
 
 
273 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.18 
 
 
418 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.86 
 
 
253 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 
265 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  44.76 
 
 
271 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.46 
 
 
409 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  9.791e-05  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.54 
 
 
255 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
262 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.10402e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  40.51 
 
 
267 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
263 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.52 
 
 
258 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.5 
 
 
255 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.08332e-07  hitchhiker  8.85497e-15 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.37 
 
 
302 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  45.56 
 
 
293 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 
263 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  48.07 
 
 
273 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  40.43 
 
 
274 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.77 
 
 
262 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  37.7 
 
 
256 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  41.37 
 
 
255 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  45.76 
 
 
250 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  42.56 
 
 
267 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.25 
 
 
269 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  36.89 
 
 
269 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  48.88 
 
 
251 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.25 
 
 
269 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.66 
 
 
268 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  36.4 
 
 
255 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  43.95 
 
 
237 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 
267 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.25 
 
 
271 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>