More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0080 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  81.94 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  81.02 
 
 		 217 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  79.26 
 
 		 227 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  81.94 
 
 		 230 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  79.26 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  74.65 
 
 		 236 aa  305  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  64.98 
 
 		 229 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  62.67 
 
 		 222 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.21 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  68.66 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  67.74 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  58.06 
 
 		 219 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  62.15 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  58.06 
 
 		 218 aa  248  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  59.26 
 
 		 221 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  59.26 
 
 		 221 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  59.35 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  58.8 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  55.56 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  60.75 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  50.24 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  50.24 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  50.24 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  50.24 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  50 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  50 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  49.76 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  49.52 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 250 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.76 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  48.8 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  47.69 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  45.37 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 291 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 280 aa  187  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.83 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.27 
 
 		 258 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.13 
 
 		 255 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.37 
 
 		 455 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  49.53 
 
 		 243 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  44.19 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  44.13 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  45.53 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  47.37 
 
 		 445 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  46.54 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  47.71 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  49.31 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  48.5 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  46.19 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  45.93 
 
 		 255 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  51.38 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  46.73 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  47.44 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 262 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  45.93 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 242 aa  177  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 242 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 224 aa  177  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  48.85 
 
 		 258 aa  177  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  47.69 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.74 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.38 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  48.11 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  47.49 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.4 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  42.99 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.73 
 
 		 252 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  44.8 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  40.28 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  48.53 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  42.53 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45.24 
 
 		 258 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>