113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0079 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  50.92 
 
 		 819 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  50.36 
 
 		 825 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  51.33 
 
 		 826 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  64.23 
 
 		 820 aa  966    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  52.64 
 
 		 815 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  76 
 
 		 821 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1581    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  76.37 
 
 		 821 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  68.33 
 
 		 819 aa  1040    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  53.99 
 
 		 795 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  67.24 
 
 		 820 aa  978    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  51.05 
 
 		 819 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  50.8 
 
 		 820 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  75.64 
 
 		 821 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  47.54 
 
 		 800 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  51.29 
 
 		 819 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  49.69 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  51.6 
 
 		 800 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  52.52 
 
 		 795 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  52.52 
 
 		 795 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  46.99 
 
 		 793 aa  554  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  41.66 
 
 		 804 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  29.74 
 
 		 817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  29.25 
 
 		 817 aa  299  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.45 
 
 		 817 aa  296  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.88 
 
 		 836 aa  292  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.87 
 
 		 836 aa  271  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  29.96 
 
 		 889 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.73 
 
 		 836 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.5 
 
 		 840 aa  260  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 884 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  29.31 
 
 		 889 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.77 
 
 		 887 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.75 
 
 		 887 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  29.14 
 
 		 879 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.82 
 
 		 850 aa  237  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  30.24 
 
 		 889 aa  237  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  29.5 
 
 		 849 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  29.66 
 
 		 897 aa  233  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  26.46 
 
 		 865 aa  232  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.97 
 
 		 878 aa  231  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.22 
 
 		 849 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 803 aa  218  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 839 aa  217  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 847 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 847 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.82 
 
 		 855 aa  212  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.51 
 
 		 845 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.69 
 
 		 845 aa  204  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.85 
 
 		 850 aa  194  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.94 
 
 		 870 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.55 
 
 		 753 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.13 
 
 		 866 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.22 
 
 		 813 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 837 aa  148  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  33.8 
 
 		 843 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.78 
 
 		 841 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.39 
 
 		 858 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 		 846 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  31.27 
 
 		 872 aa  114  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.9 
 
 		 858 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.02 
 
 		 851 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.39 
 
 		 929 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.39 
 
 		 846 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.4 
 
 		 843 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 857 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 844 aa  84.7  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.62 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  25.93 
 
 		 855 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.58 
 
 		 855 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.86 
 
 		 850 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 842 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 884 aa  74.3  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.23 
 
 		 867 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 		 842 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.55 
 
 		 855 aa  64.3  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.46 
 
 		 842 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.75 
 
 		 857 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 849 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 835 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 		 835 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  27.64 
 
 		 853 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.01 
 
 		 836 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 849 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 848 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  22.33 
 
 		 405 aa  56.6  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22.6 
 
 		 847 aa  55.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 877 aa  54.3  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  24.77 
 
 		 877 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 		 856 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  23.15 
 
 		 854 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  23.41 
 
 		 841 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 855 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.92 
 
 		 842 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.58 
 
 		 854 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 834 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  25.47 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 866 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>