More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0056 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  74.21 
 
 		 265 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  75 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  77.18 
 
 		 269 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  63.79 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  63.04 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  63.36 
 
 		 249 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  59.82 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  57.33 
 
 		 251 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  55.41 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  58.3 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  55.75 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  56.5 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  54.73 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  57.78 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  54.46 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  44.8 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  35.24 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.8 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.9 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.9 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  27.04 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  33.82 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  41.03 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.48 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  36.9 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  34.44 
 
 		 222 aa  89.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 		 224 aa  89.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  35.71 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30.84 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  40.29 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.08 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  27.16 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  35.36 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.97 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.69 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.88 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.26 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.93 
 
 		 224 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  29.53 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  37.76 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.72 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.98 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  40.31 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  38.22 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  34.69 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30.81 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  28.71 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.14 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  40.58 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.57 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  39.58 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.17 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  33.97 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29.47 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  30.37 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  32.95 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  28.42 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  29.02 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  26.98 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  29.33 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  28.14 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.79 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  27.68 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.28 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  30.9 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.09 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.93 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>