15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0050 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  64.29 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  55.26 
 
 		 76 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  59.7 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  53.33 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  72.92 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  47.44 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  46.15 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  55.56 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  63.41 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  59.09 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  38.67 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  45.76 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  43.86 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>