44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0049 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  65.03 
 
 		 565 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  64.35 
 
 		 588 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  100 
 
 		 561 aa  1108    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  64.01 
 
 		 583 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  58.01 
 
 		 552 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  50.62 
 
 		 641 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  59 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  44.66 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  44.49 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  48.47 
 
 		 511 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  46.81 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  49.88 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  46.7 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  46.1 
 
 		 507 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  41.94 
 
 		 516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  36.94 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  34.31 
 
 		 526 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  39.53 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  41.63 
 
 		 523 aa  280  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  41.63 
 
 		 523 aa  279  9e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  35.52 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  37.45 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  39.19 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  38.43 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  38.89 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  32.47 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  31.26 
 
 		 482 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.49 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  31.49 
 
 		 482 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  31.91 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  31.21 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  31.2 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  28.67 
 
 		 596 aa  150  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  29.67 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  29.11 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  30.6 
 
 		 515 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  22.57 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  29.47 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  20.6 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  23.69 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  26.14 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  23.61 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  22.44 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  29.63 
 
 		 391 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>