206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0039 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  93.45 
 
 
183 aa  323  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  92.22 
 
 
180 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  88.76 
 
 
183 aa  313  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0697  GCN5-related N-acetyltransferase  95.27 
 
 
169 aa  310  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  94.67 
 
 
169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0267  putative N-acetyltransferase  91.72 
 
 
169 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
183 aa  236  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
168 aa  194  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  51.48 
 
 
174 aa  190  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
168 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
168 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
168 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
168 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2975  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 
168 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 
168 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
168 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611795  normal  0.397187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
168 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
168 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4155  acetyltransferase  43.71 
 
 
168 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  37.95 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  26.63 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  31.97 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  26.04 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  26.04 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  26.04 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  31.97 
 
 
171 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  26.04 
 
 
173 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  26.35 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2064  hypothetical protein  24.26 
 
 
173 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00611449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  25.73 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  24.56 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5204  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  31.21 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.728318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  27.88 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  26.47 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  30.28 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  28.99 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  34.36 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  28.3 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  23.61 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
160 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377021  normal  0.0305301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  27.89 
 
 
194 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  27.67 
 
 
161 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1091  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.745657  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  27.67 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  27.67 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127294  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
178 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  27.04 
 
 
161 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  27.56 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  27.56 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>