More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0021 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  71.63 
 
 		 584 aa  820    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  75.89 
 
 		 594 aa  810    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  73.04 
 
 		 577 aa  828    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 586 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  74.27 
 
 		 594 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  71.11 
 
 		 581 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  71.72 
 
 		 589 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  58.23 
 
 		 610 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  57.89 
 
 		 586 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  54.31 
 
 		 582 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  51.03 
 
 		 599 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  51.73 
 
 		 581 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  55.84 
 
 		 580 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  51.72 
 
 		 583 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  57.89 
 
 		 583 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  50.78 
 
 		 576 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  56.6 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  54.29 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  52.89 
 
 		 645 aa  569  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  56.47 
 
 		 633 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  51.57 
 
 		 579 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  54.89 
 
 		 596 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  52.33 
 
 		 645 aa  566  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  52.16 
 
 		 617 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  54.9 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  52.49 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  52.3 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  52.49 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  52.3 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  50.88 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  50.44 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  49.91 
 
 		 579 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  50.44 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  53.91 
 
 		 589 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 583 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  52.62 
 
 		 606 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  52.23 
 
 		 586 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  51.31 
 
 		 581 aa  538  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  50.18 
 
 		 577 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  51.69 
 
 		 581 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  49.74 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  50.94 
 
 		 581 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  49.91 
 
 		 580 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  49.74 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  49.91 
 
 		 580 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  49.56 
 
 		 580 aa  525  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  51.5 
 
 		 589 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  47.92 
 
 		 580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  47.92 
 
 		 580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  48.1 
 
 		 580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  50 
 
 		 581 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  47.92 
 
 		 580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  48.94 
 
 		 576 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  48.1 
 
 		 580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  48.76 
 
 		 587 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  47.4 
 
 		 619 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  48.79 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  47.82 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  48.6 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  48.13 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  47.44 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  47.85 
 
 		 597 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  48.31 
 
 		 583 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  47.86 
 
 		 583 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  48.37 
 
 		 583 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  48.31 
 
 		 583 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  47.63 
 
 		 587 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  48.13 
 
 		 583 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  47.45 
 
 		 587 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  51.35 
 
 		 579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  49.13 
 
 		 586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  49.02 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  47.97 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  52.16 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  48.69 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  47.74 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  47.74 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  50.1 
 
 		 575 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  50.82 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  45.08 
 
 		 593 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  47.74 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  46.62 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  49.39 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  49.69 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  45.77 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  45.78 
 
 		 575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  48.78 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  45.49 
 
 		 604 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  45.77 
 
 		 590 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  42.12 
 
 		 566 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  46.12 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  49.61 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  43.83 
 
 		 617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  42.09 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2907  gamma-glutamyltransferase  42.47 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64422  normal  0.111348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  41.15 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  43.68 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  43.07 
 
 		 555 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>