86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4612 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  86.43 
 
 		 239 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  81.97 
 
 		 240 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  75.98 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  80.65 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  77.73 
 
 		 241 aa  341  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  68.66 
 
 		 227 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  57.21 
 
 		 239 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  58.33 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  52.73 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  57.41 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  55.2 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  57.87 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  54.55 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  56.81 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  55 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  52.68 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  52.8 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  52.23 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  54.3 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  55 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  53.6 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  50.47 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  50.66 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  51.61 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  51.57 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  49.07 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  47.03 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  47.5 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  44.98 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  48.7 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  47.13 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  42.79 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  45.55 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  46.5 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  46.5 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  36.87 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  42.31 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  27.75 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  32.86 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  34.73 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  32.02 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  34.08 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  32.98 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  31.07 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  33.5 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  31.34 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  28 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  27.72 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  26.67 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  31.91 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.09 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  28.19 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  31.77 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  33.88 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.96 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  32.18 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  29.05 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  27.13 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  29.05 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  30.46 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  30.77 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  28.16 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  32.67 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  30.56 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  30.11 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  21.93 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  23.24 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  26.37 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.41 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  23.78 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0316  phosphoesterase  26.88 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  32.64 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  22.7 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  28.98 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  27.42 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0534  phosphoesterase, putative  27.17 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.988231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1734  phosphoesterase, putative  23.94 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15714  normal  0.938972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1021  metallophosphoesterase  29.26 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>