More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4606 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.01 
 
 		 601 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.71 
 
 		 597 aa  789    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3245  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.46 
 
 		 596 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.532993  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  54.94 
 
 		 595 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.47 
 
 		 595 aa  869    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.34 
 
 		 599 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  66.5 
 
 		 597 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.68 
 
 		 601 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0131  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.1 
 
 		 596 aa  714    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0839  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.53 
 
 		 592 aa  686    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  83.05 
 
 		 596 aa  1039    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  54.27 
 
 		 595 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.11 
 
 		 596 aa  680    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.36 
 
 		 597 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2199  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.62 
 
 		 591 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.68 
 
 		 601 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.86 
 
 		 594 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 596 aa  1227    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2105  acyl-CoA dehydrogenase-like  57.31 
 
 		 600 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0867626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2970  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.8 
 
 		 591 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108103  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.87 
 
 		 594 aa  673    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  88.59 
 
 		 596 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.11 
 
 		 591 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  55.35 
 
 		 601 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0737  acyl-CoA dehydrogenase-like  85.57 
 
 		 596 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.13 
 
 		 596 aa  841    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.78 
 
 		 591 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.942858  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.1 
 
 		 596 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.49 
 
 		 597 aa  827    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0804  acyl-CoA dehydrogenase-like  94.63 
 
 		 596 aa  1172    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.9 
 
 		 598 aa  859    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.78 
 
 		 598 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.27 
 
 		 626 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.01 
 
 		 601 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1557  acyl-CoA dehydrogenase-like  57.57 
 
 		 593 aa  691    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.538695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  58.12 
 
 		 600 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.4 
 
 		 597 aa  854    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2868  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.69 
 
 		 592 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.23 
 
 		 598 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0023  acyl-CoA dehydrogenase-like  64.88 
 
 		 598 aa  803    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  66.83 
 
 		 597 aa  835    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  66.5 
 
 		 597 aa  835    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.63 
 
 		 596 aa  851    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0538  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.82 
 
 		 596 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 601 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.09 
 
 		 601 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.84 
 
 		 601 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.43 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.1 
 
 		 595 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  52.93 
 
 		 598 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  53.1 
 
 		 596 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.26 
 
 		 595 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.43 
 
 		 595 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.01 
 
 		 601 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.77 
 
 		 598 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.43 
 
 		 595 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.17 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.17 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.26 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.76 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.93 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.44 
 
 		 598 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.95 
 
 		 598 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.93 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  51.93 
 
 		 595 aa  618  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.34 
 
 		 601 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.52 
 
 		 612 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 		 601 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.33 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.51 
 
 		 592 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.51 
 
 		 592 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.44 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.93 
 
 		 591 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.17 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51 
 
 		 592 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.18 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.83 
 
 		 595 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.43 
 
 		 598 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.26 
 
 		 598 aa  598  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.67 
 
 		 592 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.16 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 		 596 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.67 
 
 		 592 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.01 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.08 
 
 		 595 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2768  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.2 
 
 		 596 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.33 
 
 		 601 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2387  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.2 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>