18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4444 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  93.55 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  91.94 
 
 
96 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  87.1 
 
 
97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  88.71 
 
 
96 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  75 
 
 
223 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  67.8 
 
 
220 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  65 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  67.8 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  64.41 
 
 
220 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  64.41 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  64.41 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  64.41 
 
 
216 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  69.09 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  63.49 
 
 
212 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  59.68 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  68.97 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  57.63 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>