18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4443 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  274  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  82.07 
 
 		 145 aa  224  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  71.03 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  70.34 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  54.13 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  50.83 
 
 		 223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  59.78 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  55.91 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  53.19 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  54.55 
 
 		 216 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  46.4 
 
 		 220 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  46.4 
 
 		 220 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  44.8 
 
 		 220 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  53.54 
 
 		 220 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  50.53 
 
 		 218 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  54.26 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  44.25 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  59.68 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>