More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4402 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4402  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  84.47 
 
 
175 aa  295  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  81.99 
 
 
165 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  75.16 
 
 
166 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  75.62 
 
 
166 aa  255  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  74.53 
 
 
166 aa  254  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
178 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
178 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  46.5 
 
 
181 aa  157  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0879  GCN5-related N-acetyltransferase  44.94 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  44.59 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
165 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  45.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
193 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2987  ribosomal-protein- alanine GNAT family acetyltransferase  39.62 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
172 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
163 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  39.29 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.167561  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  39.02 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  44.1 
 
 
194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
165 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  36.65 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 
163 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.38 
 
 
168 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  47.01 
 
 
168 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  38.69 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  41.1 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  41.1 
 
 
177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
173 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
162 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2953  acetyltransferase, GNAT family  36.02 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323576  hitchhiker  0.000000100965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2225  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00859735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2511  acetyltransferase, GNAT family  36.02 
 
 
170 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.037927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  36.71 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2378  acetyltransferase, GNAT family  36.02 
 
 
170 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  38.55 
 
 
162 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4759  putative acetyltransferase YhhY  38.41 
 
 
162 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  0.225822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3640  putative acetyltransferase YhhY  37.8 
 
 
162 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0272  putative acetyltransferase YhhY  37.8 
 
 
162 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.417468  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3814  putative acetyltransferase YhhY  39.02 
 
 
162 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2447  acetyltransferase  35.4 
 
 
170 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000832578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
171 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3736  putative acetyltransferase YhhY  39.02 
 
 
162 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3747  putative acetyltransferase YhhY  39.02 
 
 
162 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2181  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.4 
 
 
170 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2430  acetyltransferase, GNAT family  35.4 
 
 
170 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3916  putative acetyltransferase YhhY  39.02 
 
 
162 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.73756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03292  predicted acetyltransferase  37.8 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3884  putative acetyltransferase YhhY  37.8 
 
 
162 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3920  putative acetyltransferase YhhY  37.8 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03245  hypothetical protein  37.8 
 
 
162 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0209792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2168  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.16 
 
 
170 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2792  acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2248  acetyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000532423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2412  acetyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3857  putative acetyltransferase YhhY  38.41 
 
 
162 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
162 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
178 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3241  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2064  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3126  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1457  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1373  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.831181  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2358  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1093  acetyltransferase  38.17 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
175 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0811  acetyltransferase  32.3 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000146816  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0377  acetyltransferase  36.84 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.709528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0310  acetyltransferase  32.21 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.944664  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1316  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  28.66 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2852  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0695  hypothetical protein  34.01 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.107584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0680  hypothetical protein  34.01 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.58 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.2 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>