230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4324 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4324  OmpW  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  85.15 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  82.53 
 
 		 229 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  78.7 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  61.73 
 
 		 243 aa  300  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  63.02 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  63.02 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  56.9 
 
 		 228 aa  247  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  58.85 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  54.84 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  50.43 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  56.63 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  45.34 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  51.55 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  46.88 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  47.87 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  39.62 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  47.67 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  43.39 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  41.06 
 
 		 195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  41.06 
 
 		 195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  43.55 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  38.27 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  39.74 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  40 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.61 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  40.41 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  39.9 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  41.58 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  34.82 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  39.48 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  35.68 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  35.68 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  35.68 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  35.68 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  35.68 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  40.82 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  35.24 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  40.31 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  38.39 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  43.01 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.82 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.82 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  38.8 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  38.86 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  43.68 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  38.25 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  38.25 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  38.25 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  38.25 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  38.25 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  41.94 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  40.61 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  36.79 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.7 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  40.39 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  39.51 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  35.65 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  39.41 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  41.18 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  36.69 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  33.83 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  40.91 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  32.43 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  34.17 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  34.78 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  36.91 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  30.65 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  32.77 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1545  OmpW family protein  31.89 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281829  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  35.42 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  33.85 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  30.2 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  28.95 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  34.74 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  33.75 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  31.63 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  34.39 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  33.94 
 
 		 203 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  33.94 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  34.44 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  36.84 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  34.21 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  29.63 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  34.39 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  34.39 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  33.95 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  32.63 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  33.68 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  33.86 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  34.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>