More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4321 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
208 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  92.2 
 
 
208 aa  357  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  60.7 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  60.49 
 
 
229 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  60.8 
 
 
206 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  56.22 
 
 
208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
208 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.13 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  38.54 
 
 
215 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  40 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  38.32 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.76 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.9 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  37.13 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  32.06 
 
 
2975 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.89 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
266 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
250 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
252 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.28 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  32.67 
 
 
5778 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  32.67 
 
 
5915 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  39.47 
 
 
474 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  32.67 
 
 
4212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.3 
 
 
432 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  35.53 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  32.67 
 
 
5993 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  32.67 
 
 
5822 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  25.77 
 
 
287 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.76 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  29.29 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 
377 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.1 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
265 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  28.3 
 
 
266 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  27.67 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36.08 
 
 
268 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.48 
 
 
269 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.94 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.4 
 
 
424 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 
269 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.54 
 
 
410 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003861  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.38 
 
 
418 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
155 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.88 
 
 
285 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.38 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  37.75 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  35.42 
 
 
270 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
259 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0428  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.12 
 
 
440 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  34.74 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  37.36 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.02 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>