More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4291 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  100 
 
 
130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  81.54 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  75 
 
 
129 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  63.36 
 
 
131 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  61.07 
 
 
131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  60.31 
 
 
131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  58.78 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  60 
 
 
126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  51.64 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  42.74 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  40.94 
 
 
138 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  37.3 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  39.53 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.08 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.58 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  40.77 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  39.2 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  37.6 
 
 
137 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  38.4 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  36.23 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  36.22 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  33.6 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  35.38 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  38.52 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.23 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.54 
 
 
480 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  34.35 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.48 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37.72 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37.72 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.67 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.88 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.71 
 
 
388 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.31 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  36.92 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.2 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
389 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  34.96 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 
323 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.51 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  27.69 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.34 
 
 
379 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 
163 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 
438 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.81 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.76 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  34.13 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  34.13 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0847  Rhodanese domain protein  38.4 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 
460 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  35.8 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.2 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.48 
 
 
386 aa  60.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.4 
 
 
378 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
480 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  30.16 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  42.25 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
461 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.91 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
361 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.33 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  30.08 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>