More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4245 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  73.82 
 
 		 692 aa  989    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  76.1 
 
 		 687 aa  1048    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  100 
 
 		 680 aa  1379    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  78.09 
 
 		 695 aa  1085    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  92.5 
 
 		 681 aa  1251    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  74.62 
 
 		 690 aa  993    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  88.09 
 
 		 676 aa  1186    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  46.46 
 
 		 683 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  40.76 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  40.82 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  40.95 
 
 		 674 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40.67 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.43 
 
 		 665 aa  492  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  39.97 
 
 		 697 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  39.82 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  39.85 
 
 		 699 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  37.62 
 
 		 651 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  37.46 
 
 		 651 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  37.58 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  34.71 
 
 		 640 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  34.14 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  35.81 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.12 
 
 		 645 aa  350  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  35.28 
 
 		 648 aa  347  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  33.12 
 
 		 656 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  34.15 
 
 		 615 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  35.63 
 
 		 621 aa  317  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  30.64 
 
 		 646 aa  294  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  41.37 
 
 		 569 aa  280  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.93 
 
 		 490 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  39.79 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.34 
 
 		 503 aa  204  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.97 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  42.5 
 
 		 517 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.73 
 
 		 473 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.69 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.23 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.82 
 
 		 475 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.82 
 
 		 473 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  41.74 
 
 		 741 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.13 
 
 		 475 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.11 
 
 		 475 aa  194  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.18 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.74 
 
 		 480 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 		 577 aa  187  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  34.52 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 577 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.61 
 
 		 429 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  40.6 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  40.6 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.4 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  37.45 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.39 
 
 		 438 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.3 
 
 		 448 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.89 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  40.17 
 
 		 437 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  31.12 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  39.43 
 
 		 472 aa  177  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.49 
 
 		 471 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  32.59 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  36.25 
 
 		 581 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.09 
 
 		 362 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  32.63 
 
 		 527 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  56.83 
 
 		 287 aa  170  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.06 
 
 		 490 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.29 
 
 		 441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  34.63 
 
 		 380 aa  167  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  30.95 
 
 		 464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.73 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  28.39 
 
 		 470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  31.12 
 
 		 464 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  37.3 
 
 		 459 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.48 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  32.4 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.55 
 
 		 503 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  39.42 
 
 		 429 aa  161  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  28.83 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.55 
 
 		 312 aa  159  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  37.56 
 
 		 470 aa  157  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  29.64 
 
 		 437 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  31.06 
 
 		 513 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  38.08 
 
 		 457 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.69 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.56 
 
 		 433 aa  156  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  36.44 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  29.41 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.55 
 
 		 465 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.67 
 
 		 491 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  28.5 
 
 		 482 aa  153  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  37.17 
 
 		 436 aa  153  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  27.54 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30.42 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.44 
 
 		 353 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.13 
 
 		 446 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  29.38 
 
 		 457 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  32.02 
 
 		 462 aa  151  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.5 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>