More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4043 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  688    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  81.2 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  81.2 
 
 		 361 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  74.71 
 
 		 351 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.76 
 
 		 352 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  54.86 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  56.18 
 
 		 348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  56.18 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  54.81 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  54.41 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  52.6 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  52.6 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  52.31 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  52.31 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  52.31 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  52.31 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  52.23 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 347 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  51.92 
 
 		 353 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  51.93 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  51.18 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  51.5 
 
 		 342 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 		 359 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  51.16 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.86 
 
 		 370 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.18 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.05 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  41.74 
 
 		 350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.77 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  41.14 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.4 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.02 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  45.33 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.1 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.32 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.32 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  46.9 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 370 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  47.2 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.65 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  42.49 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.34 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.35 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  46.65 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.59 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.23 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 		 353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.37 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  41.71 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  53 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.57 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  50.17 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  41.35 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.11 
 
 		 426 aa  265  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.91 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.61 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.59 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.76 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  41.14 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  39.59 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.51 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  45.48 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  43.8 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  51.75 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  45.18 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>