19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4029 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  94.79 
 
 		 96 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  91.67 
 
 		 96 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  84.04 
 
 		 97 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  69.41 
 
 		 223 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  58.33 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  54.13 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  58.06 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  93.55 
 
 		 66 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  55.79 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  61.45 
 
 		 220 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  59.55 
 
 		 220 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  59.3 
 
 		 216 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  59.04 
 
 		 220 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  59.04 
 
 		 220 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  61.54 
 
 		 212 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  56.47 
 
 		 218 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  58.24 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0933  hypothetical protein  44.74 
 
 		 586 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>