17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4024 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  86.67 
 
 
154 aa  273  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  85.14 
 
 
149 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  67.57 
 
 
152 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  31.47 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  31.47 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  34.07 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  29.23 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  26.77 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  24.22 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  27.68 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  28.7 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>