48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3984 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3984  Heme oxygenase (decyclizing)  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85445  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3739  Heme oxygenase (decyclizing)  74.89 
 
 		 227 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0567134  hitchhiker  0.000363645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1727  Heme oxygenase  69.27 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1310  Heme oxygenase (decyclizing)  59.33 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.608398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6429  heme oxygenase  50.52 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3872  Heme oxygenase  40 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  normal  0.243926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2962  Heme oxygenase  36 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2851  heme oxygenase  33.5 
 
 		 238 aa  128  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3767  Heme oxygenase  33.83 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00293088  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0166  Heme oxygenase (decyclizing)  36.14 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17811  Heme oxygenase  31.71 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1686  Heme oxygenase  33.68 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.454788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0335  Heme oxygenase (decyclizing)  33 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0979075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17151  Heme oxygenase  34.31 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.714978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3635  Heme oxygenase  34.33 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1858  Heme oxygenase (decyclizing)  32.66 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17861  Heme oxygenase  33.16 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18031  Heme oxygenase  33.16 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0196  Heme oxygenase (decyclizing)  31.92 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3827  Heme oxygenase  31.03 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1414  Heme oxygenase  33.66 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1380  Heme oxygenase  33.66 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22411  Heme oxygenase  35.57 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20441  Heme oxygenase  32.47 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.810996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1169  Heme oxygenase  32.47 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4780  Heme oxygenase  32.46 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  33.51 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0101  Heme oxygenase  30.37 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0098  Heme oxygenase  30.37 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1054  Heme oxygenase  35.5 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.623466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35580  heme oxygenase  35.36 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2758  Heme oxygenase  35.15 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126607  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2604  Heme oxygenase  32.09 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3387  heme oxygenase  25.62 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1431  Heme oxygenase  28.87 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  34.45 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0203  heme oxygenase 2  28.27 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0205  heme oxygenase  28.27 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2345  heme oxygenase (decyclizing)  29.58 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5902  predicted protein  29.02 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0441  Heme oxygenase  29.41 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12588  predicted protein  31.28 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0079  Heme oxygenase  30.29 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4613  Heme oxygenase  30.94 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3085  Heme oxygenase  33.69 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3241  Heme oxygenase  29.73 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00174182  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08750  heme oxygenase  33.86 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01200  heme oxygenase 2, putative  22.39 
 
 		 364 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>