33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3924 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.0000157363  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3682  hypothetical protein  90.91 
 
 		 198 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0758613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1813  hypothetical protein  89.85 
 
 		 197 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4251  hypothetical protein  83.76 
 
 		 195 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173324  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3380  hypothetical protein  78.1 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0516  hypothetical protein  75.23 
 
 		 214 aa  306  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6564  hypothetical protein  90.68 
 
 		 204 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3485  hypothetical protein  70.22 
 
 		 182 aa  254  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1021  hypothetical protein  66.27 
 
 		 197 aa  245  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1620  hypothetical protein  64.6 
 
 		 195 aa  235  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4040  hypothetical protein  66.46 
 
 		 214 aa  234  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.10225  normal  0.0382421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1717  hypothetical protein  58.5 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1791  hypothetical protein  58 
 
 		 249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.7405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3530  hypothetical protein  59.47 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2127  hypothetical protein  58 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1687  hypothetical protein  57.07 
 
 		 200 aa  228  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4843  hypothetical protein  63.19 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2609  hypothetical protein  56.77 
 
 		 199 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3082  hypothetical protein  54.4 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.211768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3339  hypothetical protein  55.21 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1596  hypothetical protein  59.28 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00989561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1540  hypothetical protein  59.28 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1572  hypothetical protein  58.68 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2210  hypothetical protein  52.58 
 
 		 197 aa  204  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2168  hypothetical protein  50.79 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0615786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1021  hypothetical protein  46.88 
 
 		 197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0952714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1688  hypothetical protein  41.12 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0108944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1182  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0791  hypothetical protein  48.24 
 
 		 267 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.219826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1340  hypothetical protein  48.12 
 
 		 259 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299322  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0988  hypothetical protein  46.67 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0140  hypothetical protein  43.22 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4773  hypothetical protein  45.62 
 
 		 260 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0149963  normal  0.0439036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>