More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3920 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  59.29 
 
 		 878 aa  1037    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  57.6 
 
 		 916 aa  983    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  77.65 
 
 		 888 aa  1404    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  58.76 
 
 		 935 aa  1011    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  80.63 
 
 		 927 aa  1415    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.77 
 
 		 942 aa  943    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  86.03 
 
 		 937 aa  1577    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 934 aa  1869    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  80.09 
 
 		 927 aa  1404    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  80.49 
 
 		 934 aa  1468    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  81.1 
 
 		 922 aa  1462    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  57.55 
 
 		 921 aa  989    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  89.61 
 
 		 925 aa  1626    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  57.05 
 
 		 921 aa  988    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  77.87 
 
 		 911 aa  1405    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  45.26 
 
 		 910 aa  717    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.64 
 
 		 928 aa  822    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 		 916 aa  989    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  86.61 
 
 		 937 aa  1593    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.57 
 
 		 766 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 796 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.5 
 
 		 801 aa  495  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  39.43 
 
 		 870 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1063 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 728 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  44.77 
 
 		 742 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 760 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.1 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 822 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.91 
 
 		 769 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.85 
 
 		 769 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.2 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.98 
 
 		 770 aa  403  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.28 
 
 		 1104 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 		 803 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.67 
 
 		 783 aa  391  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.31 
 
 		 774 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.86 
 
 		 785 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.09 
 
 		 770 aa  378  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 770 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 687 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 719 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.22 
 
 		 601 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 604 aa  360  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 686 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 652 aa  353  7e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 715 aa  352  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  33.24 
 
 		 751 aa  352  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 691 aa  351  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 650 aa  348  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  33.72 
 
 		 714 aa  347  7e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 675 aa  346  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.15 
 
 		 639 aa  344  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 		 744 aa  342  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 681 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 685 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 694 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 673 aa  332  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 660 aa  330  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 653 aa  328  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.02 
 
 		 806 aa  328  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.97 
 
 		 674 aa  327  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.09 
 
 		 681 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 747 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 729 aa  326  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 666 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 695 aa  324  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  34.48 
 
 		 625 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.25 
 
 		 669 aa  324  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.25 
 
 		 669 aa  324  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.04 
 
 		 654 aa  323  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 677 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  30.8 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  42.89 
 
 		 610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  35.25 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 812 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  30.57 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  35.29 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.29 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 759 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  31.15 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 697 aa  321  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.2 
 
 		 736 aa  321  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.61 
 
 		 670 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  30.93 
 
 		 702 aa  320  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 745 aa  320  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.89 
 
 		 654 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.89 
 
 		 654 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.89 
 
 		 654 aa  320  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 649 aa  320  9e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.69 
 
 		 652 aa  320  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 654 aa  320  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 747 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.89 
 
 		 652 aa  320  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.74 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>