More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3840 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 347 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  82.37 
 
 		 361 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  72.3 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  40.98 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  43.72 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  45.91 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.45 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 1250 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  40.79 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  40.28 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  39 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.08 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 280 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  35.98 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  43.93 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  41.31 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 274 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.78 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 930 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.64 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.39 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.7 
 
 		 466 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 663 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 898 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 898 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 		 774 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  34.12 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 1035 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 274 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  37.32 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0861  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 1032 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0412  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0891  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0211715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.43 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.7 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  35.43 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>