More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3734 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 591 aa  1148    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  83.61 
 
 		 592 aa  858    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  73.77 
 
 		 591 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  89.71 
 
 		 593 aa  988    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  47.37 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  46.84 
 
 		 630 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  48.7 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  48.6 
 
 		 632 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  49.47 
 
 		 597 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  46.21 
 
 		 629 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  45.83 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  47.67 
 
 		 594 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  44.43 
 
 		 608 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  42.46 
 
 		 583 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  39 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.81 
 
 		 577 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  38.06 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  42.54 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  41.77 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  38.09 
 
 		 650 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 594 aa  336  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  39.38 
 
 		 533 aa  333  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  35.17 
 
 		 652 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.51 
 
 		 574 aa  330  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  36.16 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.64 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.32 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  37.48 
 
 		 661 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  37.48 
 
 		 661 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  37.39 
 
 		 648 aa  323  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  36.99 
 
 		 678 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 668 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.96 
 
 		 669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 668 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 668 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  37.5 
 
 		 648 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  37.44 
 
 		 663 aa  320  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 		 661 aa  320  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.96 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.96 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  37.96 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  37.96 
 
 		 663 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  37.89 
 
 		 656 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.96 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.96 
 
 		 669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  37.33 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  35.56 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  37.5 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  37.28 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  37.28 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  37.79 
 
 		 661 aa  318  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  37.01 
 
 		 648 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  38.73 
 
 		 664 aa  317  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  35.29 
 
 		 628 aa  317  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  33.27 
 
 		 662 aa  316  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 668 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  36.76 
 
 		 648 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  37.52 
 
 		 674 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.06 
 
 		 648 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  37.17 
 
 		 666 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  35.9 
 
 		 589 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.61 
 
 		 602 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.61 
 
 		 602 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.71 
 
 		 654 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.61 
 
 		 602 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  35.9 
 
 		 589 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 		 670 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.3 
 
 		 649 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.9 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 659 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.43 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  35.53 
 
 		 589 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.65 
 
 		 600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.3 
 
 		 617 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 667 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.95 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 		 670 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.91 
 
 		 605 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 649 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 659 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  35.24 
 
 		 616 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  39.18 
 
 		 659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  34.83 
 
 		 620 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  35.17 
 
 		 589 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 		 620 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  35.71 
 
 		 589 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  38.97 
 
 		 642 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 		 642 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  38.46 
 
 		 661 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  36.33 
 
 		 660 aa  306  8.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  38.14 
 
 		 661 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  34.57 
 
 		 649 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.83 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.83 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 661 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.28 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  35.15 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>