More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3733 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  61.09 
 
 		 561 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  62.75 
 
 		 563 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  61.87 
 
 		 563 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  61.87 
 
 		 563 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  61.9 
 
 		 606 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  62.21 
 
 		 562 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  61.09 
 
 		 561 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  63.69 
 
 		 568 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  62.7 
 
 		 561 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  62.41 
 
 		 576 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  100 
 
 		 575 aa  1108    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  79.33 
 
 		 583 aa  848    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  77.6 
 
 		 574 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  63.15 
 
 		 555 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  61.99 
 
 		 606 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  88.65 
 
 		 556 aa  962    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  61.69 
 
 		 562 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  63.86 
 
 		 567 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  64.36 
 
 		 585 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  61.69 
 
 		 558 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  61.69 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  61.69 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  61.51 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  61.51 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  63.49 
 
 		 541 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  61.69 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  61.51 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  61.69 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  61.51 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  60.2 
 
 		 678 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  61.58 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  61.58 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  61.58 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  61.58 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  61.58 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  60.76 
 
 		 558 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  63.59 
 
 		 549 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  54.93 
 
 		 613 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  59.03 
 
 		 566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  60.6 
 
 		 619 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  60.6 
 
 		 619 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  61.06 
 
 		 615 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  59.13 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  57.32 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  57.32 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  58.45 
 
 		 569 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  56.17 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  58.14 
 
 		 605 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  58.14 
 
 		 605 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  57.78 
 
 		 605 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  54.76 
 
 		 562 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  60.07 
 
 		 607 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  56.55 
 
 		 565 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  53.44 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  53.12 
 
 		 583 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  56.15 
 
 		 569 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  56.82 
 
 		 572 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  56.23 
 
 		 579 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  57.09 
 
 		 577 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  69.34 
 
 		 408 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  52.34 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  53.46 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  53.46 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  53.46 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  58.51 
 
 		 607 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  51.08 
 
 		 564 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  53.46 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  69.15 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  54 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  52.94 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  52.34 
 
 		 564 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  52.83 
 
 		 567 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  54.94 
 
 		 585 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  54.88 
 
 		 564 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4142  sodium/hydrogen exchanger  68.52 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4379  sodium/hydrogen exchanger  53.14 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4030  sodium/hydrogen exchanger  68.52 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  55.33 
 
 		 580 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1059  putative potassium efflux system protein  54.16 
 
 		 577 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1216  putative potassium efflux system protein  54.16 
 
 		 577 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1635  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  55.04 
 
 		 583 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0369  putative potassium efflux system protein  53.99 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0048  putative potassium efflux system protein  54.16 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0220  potassium-efflux system protein  54.5 
 
 		 695 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.559394  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1194  potassium efflux system protein, putative  54.3 
 
 		 581 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0077476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  46.31 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  45.5 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  58.56 
 
 		 582 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  44.06 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  55.58 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  49.79 
 
 		 631 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 598 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  45.36 
 
 		 667 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  45.3 
 
 		 684 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2272  sodium/hydrogen exchanger  41.09 
 
 		 578 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.668389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  42.5 
 
 		 674 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2030  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.56 
 
 		 509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 		 671 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  36.58 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 673 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>