More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3645 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  37.72 
 
 		 1083 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.1 
 
 		 1065 aa  980    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.33 
 
 		 1006 aa  941    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  46.03 
 
 		 1075 aa  911    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.73 
 
 		 1065 aa  985    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.64 
 
 		 1065 aa  981    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  46.69 
 
 		 1065 aa  987    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  46.45 
 
 		 1065 aa  975    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.69 
 
 		 1065 aa  983    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  42.67 
 
 		 1063 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  45.08 
 
 		 1071 aa  880    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  46.13 
 
 		 1053 aa  936    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.64 
 
 		 1065 aa  981    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  100 
 
 		 1072 aa  2189    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  87.24 
 
 		 1075 aa  1922    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  41.91 
 
 		 1064 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  43.78 
 
 		 1059 aa  836    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  46.73 
 
 		 1065 aa  984    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  47.96 
 
 		 1055 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  47.03 
 
 		 1065 aa  976    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  41.78 
 
 		 1079 aa  747    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  41.78 
 
 		 1079 aa  747    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  56.23 
 
 		 1074 aa  1194    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  37.38 
 
 		 1096 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  46.47 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  39.39 
 
 		 486 aa  340  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  39.2 
 
 		 458 aa  280  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  36.29 
 
 		 1257 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  28.39 
 
 		 675 aa  246  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  31.95 
 
 		 561 aa  244  7e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 		 1357 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.3 
 
 		 613 aa  241  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.84 
 
 		 1338 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.13 
 
 		 1341 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  29.64 
 
 		 695 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  32.12 
 
 		 608 aa  232  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.67 
 
 		 610 aa  228  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.83 
 
 		 596 aa  226  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.79 
 
 		 607 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.22 
 
 		 613 aa  225  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  30.68 
 
 		 623 aa  225  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.57 
 
 		 599 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  33.33 
 
 		 602 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.57 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.9 
 
 		 614 aa  218  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  31.99 
 
 		 563 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.99 
 
 		 584 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  34.57 
 
 		 401 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.79 
 
 		 599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.27 
 
 		 599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  31.13 
 
 		 464 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.12 
 
 		 599 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  33.28 
 
 		 628 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  30.19 
 
 		 1409 aa  213  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 		 1342 aa  211  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.38 
 
 		 604 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.82 
 
 		 604 aa  211  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.49 
 
 		 599 aa  210  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 		 1407 aa  209  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.91 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.08 
 
 		 607 aa  207  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.8 
 
 		 1401 aa  207  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  28.38 
 
 		 741 aa  206  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  31.17 
 
 		 1400 aa  206  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  34.69 
 
 		 615 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1394 aa  204  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 1403 aa  204  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.87 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  30.02 
 
 		 613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.85 
 
 		 598 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.72 
 
 		 591 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.87 
 
 		 594 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  30.03 
 
 		 1524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.43 
 
 		 600 aa  201  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 		 1384 aa  201  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.92 
 
 		 614 aa  201  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  37.1 
 
 		 526 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.48 
 
 		 612 aa  200  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.23 
 
 		 1383 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.16 
 
 		 600 aa  200  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  34.64 
 
 		 538 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  36.51 
 
 		 376 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.63 
 
 		 610 aa  199  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.06 
 
 		 969 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 1405 aa  195  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.22 
 
 		 629 aa  195  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.22 
 
 		 626 aa  195  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  30.26 
 
 		 623 aa  194  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  30.96 
 
 		 1397 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.62 
 
 		 1232 aa  193  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.26 
 
 		 594 aa  193  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  35.58 
 
 		 539 aa  193  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  31.17 
 
 		 1396 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  31.24 
 
 		 609 aa  191  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 		 1312 aa  191  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  32.09 
 
 		 446 aa  191  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  31.31 
 
 		 1397 aa  191  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  30.83 
 
 		 599 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.75 
 
 		 1427 aa  190  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  35.9 
 
 		 539 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>