179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3478 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  100 
 
 		 314 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  59.68 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  54.4 
 
 		 313 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  44.83 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  36.51 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  34.88 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  36.33 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  34.44 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  32.52 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0725  putative transposase  31.18 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0206  putative transposase  34.11 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0693887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  26.98 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  27.46 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  27.46 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0048  putative transposase  32.27 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000122957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  26.26 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  25.9 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  30.18 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  25.9 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06214  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03894  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 418 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  25.54 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  30.47 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  30.47 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 484 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  30.47 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  26.65 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  26.65 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  26.65 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  26.65 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  30.47 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  30.47 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04440  ISXo2 putative transposase  25.54 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  25.18 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0921  hypothetical protein  41.23 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  30.47 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4134  putative transposase  29.17 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436549  normal  0.202806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  28.47 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  28.47 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  28.47 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  27.85 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2134  hypothetical protein  24.48 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2666  hypothetical protein  24.48 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0915  hypothetical protein  24.48 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  27.18 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  27.18 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  27 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  27.33 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  27.33 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  26.89 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  27.36 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  27.36 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  27.18 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01827  putative transposase  35.38 
 
 		 448 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  26.88 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  27.52 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  27.81 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>