151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3372 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  84.02 
 
 
169 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  80.75 
 
 
166 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  74.19 
 
 
166 aa  233  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  70.51 
 
 
166 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  70.32 
 
 
166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  65.16 
 
 
166 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  58.39 
 
 
167 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  55.06 
 
 
164 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
167 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  36.6 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
159 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
173 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.19 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  32.43 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.19 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  28.19 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  33.55 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  26.97 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  29.61 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  32.24 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  31.88 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  29.8 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  32.45 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  32.03 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  30.33 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  35.04 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  29.56 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  32.65 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  29.56 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  34.01 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  28.48 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  31.08 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  28.93 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
177 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  31.97 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  31.62 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
237 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  27.35 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  27.35 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000985875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4860  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0123  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  31.67 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
144 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1139  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.56 
 
 
155 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>