More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3153 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  68.13 
 
 		 753 aa  1044    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  81.23 
 
 		 764 aa  1212    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 759 aa  1514    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  89.36 
 
 		 760 aa  1321    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  71.29 
 
 		 756 aa  1077    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  49.63 
 
 		 725 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45.31 
 
 		 723 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  43.93 
 
 		 723 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  38.61 
 
 		 744 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.85 
 
 		 729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.84 
 
 		 754 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 		 729 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  37.74 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  37.23 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.81 
 
 		 737 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 721 aa  329  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.26 
 
 		 696 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  31.63 
 
 		 753 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 		 741 aa  298  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 		 758 aa  297  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 734 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.66 
 
 		 758 aa  285  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  32.4 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.83 
 
 		 758 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.91 
 
 		 758 aa  271  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.63 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 		 746 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 794 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.34 
 
 		 658 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.72 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  32.47 
 
 		 650 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.11 
 
 		 656 aa  233  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.32 
 
 		 672 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 		 641 aa  216  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.7 
 
 		 643 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.95 
 
 		 694 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31 
 
 		 936 aa  204  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 696 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  34.7 
 
 		 499 aa  195  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 645 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 		 667 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.4 
 
 		 614 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 638 aa  187  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 		 665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  40.45 
 
 		 717 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  36.24 
 
 		 499 aa  177  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.26 
 
 		 701 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 		 607 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.12 
 
 		 744 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  32.25 
 
 		 708 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.81 
 
 		 761 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 735 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 712 aa  167  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.11 
 
 		 652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.71 
 
 		 636 aa  163  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.22 
 
 		 635 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  38.53 
 
 		 702 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  41.41 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.37 
 
 		 611 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.6 
 
 		 675 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.17 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 860 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.92 
 
 		 597 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  33.54 
 
 		 671 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.91 
 
 		 703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.68 
 
 		 757 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 		 284 aa  147  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 713 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  35.5 
 
 		 911 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 		 864 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 		 861 aa  144  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 858 aa  144  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 654 aa  144  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  34.31 
 
 		 483 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.31 
 
 		 483 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 		 726 aa  143  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  35.43 
 
 		 441 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.08 
 
 		 701 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 671 aa  142  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.51 
 
 		 681 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  34.77 
 
 		 593 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 		 859 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  30.08 
 
 		 701 aa  141  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  34.98 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.2 
 
 		 643 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.46 
 
 		 1207 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  36.44 
 
 		 643 aa  138  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.8 
 
 		 678 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.1 
 
 		 582 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  39.17 
 
 		 903 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 		 536 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.02 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.04 
 
 		 648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.15 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.04 
 
 		 637 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 		 421 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 632 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>