More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3076 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.45 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 		 257 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  44 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  47.43 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  40.56 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 275 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  36.8 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.15 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.11 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.96 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>