More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3031 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  78.76 
 
 		 229 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  76.86 
 
 		 233 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  66.82 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.76 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  65.14 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  63.3 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  60.54 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  60.71 
 
 		 691 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  60.18 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  60.18 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  60.18 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  60.71 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  59.73 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  59.73 
 
 		 232 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  59.82 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  58.88 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.53 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  57.53 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.53 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.96 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  56.16 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.46 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  51.96 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  51.96 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  50.22 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  53.78 
 
 		 285 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.01 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.33 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.44 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  51.17 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  52.21 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.14 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.45 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  54.63 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  50.96 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.75 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  50 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  55.91 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  49.31 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  49.31 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.56 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  51.35 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.21 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.52 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  48.23 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  48.23 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  48.85 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.77 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  52.02 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  45.29 
 
 		 279 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.26 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.31 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.82 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  50.74 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.19 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.19 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  54.07 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  51.3 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.51 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  42.79 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  44.61 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  43.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.79 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.84 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.74 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.4 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  41.12 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.71 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  57.69 
 
 		 201 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  42.72 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  40.74 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.19 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  40.19 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.19 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.62 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.91 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  41.27 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  41.15 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  43.11 
 
 		 187 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.98 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  31.75 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  36.41 
 
 		 202 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  41.54 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1054  DJ-1/PfpI family protein  41.54 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1771  DJ-1/PfpI family protein  41.54 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0688  putative isonitrile hydratase  41.54 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  31.22 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2029  putative isonitrile hydratase  41.54 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  41.54 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>