More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3004 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  54.42 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  46.42 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  45.97 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  45.28 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  45.51 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  47.39 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  47.04 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  44.67 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  39.93 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  39.01 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  38.11 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  37.54 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  37.2 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.78 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.87 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.11 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  33.11 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  36.01 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.36 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32.06 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  34.78 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  36.65 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  35.18 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.23 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.84 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.65 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  31.54 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.85 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  32.3 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.17 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  36.33 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  34.3 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.14 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  31.9 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  31 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  33.46 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.8 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.29 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.21 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.21 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.34 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  32.51 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  31.45 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.86 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  31.1 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.65 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.29 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.24 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  28.9 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.24 
 
 		 364 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  30.93 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  31.53 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  31.53 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  34.57 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.72 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.58 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.28 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.19 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.19 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.19 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.45 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.45 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.38 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>