59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2858 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  73.52 
 
 		 541 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  74.7 
 
 		 494 aa  736    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  91.58 
 
 		 558 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  83.21 
 
 		 536 aa  899    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  100 
 
 		 558 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  72.4 
 
 		 532 aa  788    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  71.21 
 
 		 538 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  45.62 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40 
 
 		 522 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  53.19 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  39.8 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 521 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.35 
 
 		 521 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  47.32 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  34.62 
 
 		 638 aa  281  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  35.14 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  36.49 
 
 		 535 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  36.34 
 
 		 869 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  33.42 
 
 		 844 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 905 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 895 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 		 889 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 		 919 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 889 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 899 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 862 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  34.03 
 
 		 863 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  36.24 
 
 		 895 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 863 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 		 863 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 		 885 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  30.02 
 
 		 889 aa  188  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 903 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.75 
 
 		 863 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 917 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 868 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.13 
 
 		 944 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 859 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 		 842 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 831 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 295 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.85 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  29.7 
 
 		 308 aa  94.4  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  25.29 
 
 		 366 aa  91.3  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  26.9 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  23.94 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  28.23 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  25.76 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  26 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  27.05 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.55 
 
 		 1290 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  22.82 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  25.64 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  24.69 
 
 		 249 aa  50.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  25.1 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  22.16 
 
 		 620 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>