More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2811 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 562 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 781 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 554 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 567 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 567 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 556 aa  695    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 565 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 559 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 570 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 552 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 569 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 564 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 551 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 551 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 564 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 558 aa  705    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 565 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  87.75 
 
 		 563 aa  1015    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  76.3 
 
 		 559 aa  924    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 555 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 565 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 566 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 565 aa  721    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 556 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 572 aa  731    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 553 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  62.36 
 
 		 555 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 568 aa  722    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 555 aa  725    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3674  glutaminyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 606 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620823  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 561 aa  718    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 565 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 778 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 561 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 561 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 		 568 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 569 aa  719    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 556 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 590 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 777 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  85.19 
 
 		 559 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 567 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  90.32 
 
 		 560 aa  1072    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 556 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 570 aa  736    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  93.94 
 
 		 561 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 576 aa  668    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 583 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  76.48 
 
 		 558 aa  915    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 579 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 580 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 540 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 777 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 565 aa  717    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 552 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 552 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 		 587 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 563 aa  720    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 589 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 556 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 		 556 aa  713    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 557 aa  638    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 556 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 564 aa  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 567 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 556 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 556 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 565 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 569 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 582 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 554 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 559 aa  628  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 556 aa  631  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 566 aa  628  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 596 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>