More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2723 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
342 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.41 
 
 
1022 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.76 
 
 
988 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.18 
 
 
784 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.34 
 
 
818 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.49 
 
 
1056 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 
556 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
649 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 
392 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.09 
 
 
1056 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36 
 
 
706 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.86 
 
 
462 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  35.02 
 
 
706 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
878 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.06 
 
 
820 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.44 
 
 
542 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  37.24 
 
 
581 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
371 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.29 
 
 
810 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
306 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.94 
 
 
539 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.76 
 
 
738 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.66 
 
 
582 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
1421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.94 
 
 
629 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
605 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
289 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  37.13 
 
 
306 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
543 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.29 
 
 
778 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
406 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
406 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 
331 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.74 
 
 
334 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.32 
 
 
750 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.18 
 
 
471 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.46 
 
 
839 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  36.07 
 
 
385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 
632 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.33 
 
 
746 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.14 
 
 
442 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 
1240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.75 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
260 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
352 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 
308 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
319 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
1827 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
292 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
318 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
927 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
280 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 
295 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 
343 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.14 
 
 
286 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
286 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
515 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
1276 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
547 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
404 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
3560 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 
280 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  32.16 
 
 
295 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 
458 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
428 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
301 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
446 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
4489 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.12 
 
 
237 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
292 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.47 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
3035 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  33.48 
 
 
612 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.67 
 
 
1694 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
3145 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.49 
 
 
764 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.35 
 
 
875 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
450 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.89 
 
 
1007 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
615 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  32.64 
 
 
695 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
562 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
421 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  39.55 
 
 
233 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  34.8 
 
 
668 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>